上海CUT&Tag：新一代ChIP-Seq技术云序供

技术简介

CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法，是新一代超微量ChIP-Seq技术，适用于无ChIP级别抗体的蛋白研究。与传统的ChIP-Seq研究方法相比，该技术无需交联、超声打断、末端抹平和接头连接等操作，因此具有省时***、所需的样品量少、背景信号低和可重复性好等优点，甚至可用于单细胞水平测序。CUT&Tag有望将蛋白质-DNA互作的研究变成一种类似PCR反应的常规操作，对基因调控、表观遗传等领域的研究具有革命性的意义。

产品优势

   样品起始量低：能够对及少量样品进行分析

   无需ChIP级别抗体：无需提供ChIP级别抗体

   性价比高：背景噪音低，所需测序深度少

   实验重复性好：实验重复结果一致性好

技术原理

ChiTag是Protein A蛋白与Tn5转座酶的融合蛋白，当抗体结合目的蛋白（如转录因子、组蛋白等）后，Protein A蛋白可直接结合抗体，携带的Tn5转座酶可特异性的切割目的蛋白附近的DNA片段，并将DNA片段连上接头，文库构建之后可进行高通量测序。 

图注：云序生物CUT&Tag实验流程

样本要求

1）样品类型：细胞、**，其它样品信息请详询

2）样品量

细胞：5×10⁵

**：5mg

3）样品保存：细胞样品或新鲜**块，液氮冻存后，-80℃ 保存。

4）样品运输：干冰运输。

案例解析

CUT&Tag技术研究蛋白质-DNA互作的优势

原文：CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells

期刊：Nature Communications 发表时间：20190429 影响因子： 11.878

在生物学研究中，DNA与蛋白质之间的互作是至关重要的，参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程，几乎涉及所有的生命活动。目前研究两者互作的方法很多，作者选择了传统的研究手段ChIP-seq，优化的CUT&RUN方法，以及新方法CUT&Tag共同研究组蛋白H3K27me3。通过比对实验结果，发现CUT&Tag有比较低的背景噪声以及*强的信号。通过对H3K4me1修饰物进行分析，显示CUT&Tag的灵敏度比较高，实验可重复性比较好。 

图1. CUT&Tag方法的优点